Bảo tàng Mỹ Sơn nằm cạnh suối Khe Thẻ, cách khu di tích Mỹ Sơn khoảng 2km về hướng Tây Bắc, được khởi công xây dựng vào tháng 6/2004 và hoàn thành vào tháng 3/2005 từ nguồn vốn viện trợ không hoàn lại của chính phủ Nhật Bản. Phòng trưng bày là nơi cung cấp thông tin, kiến thức chung về di tích Mỹ Sơn để giúp du khách hình dung chung về di tích Mỹ Sơn trước khi vào tham quan di tích Mỹ Sơn.